晶码战士第三部全集影片剧情接续TV动画，卡塔莉娜多次成功避开毁灭性结局后，从魔法学园顺利毕业，过上安稳平静的生活。某日，卡塔莉娜偶遇一支外国商队，并由此结识了一位寡言冷漠的异国少年亚齐尔，虽初次见面，却让卡塔莉娜感到似曾相识，也随之陷入未知的危机之中。